Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RTL8BQ17RB0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms