Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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