Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRNQ16849 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms