Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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