Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
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