Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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