Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALX1Q15699 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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