Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PUM3Q15397 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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