Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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