Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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ARHGEF6Q15052 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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ARHGEF6Q15052 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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ARHGEF6Q15052 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARHGEF6Q15052 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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ARHGEF6Q15052 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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ARHGEF6Q15052 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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ARHGEF6Q15052 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARHGEF6Q15052 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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