Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms