Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A1Q14973 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms