Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms