Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RFTN1Q14699 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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