Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA3AQ14563 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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