Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HNF4GQ14541 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms