Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM53BQ14153 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FAM53BQ14153 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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FAM53BQ14153 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM53BQ14153 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM53BQ14153 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM53BQ14153 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM53BQ14153 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM53BQ14153 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM53BQ14153 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM53BQ14153 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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