Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM29Q14134 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM29Q14134 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms