Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms