Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H2Q13888 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms