Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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