Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CUL4AQ13619 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CUL4AQ13619 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL4AQ13619 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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