Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME3Q13232 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME3Q13232 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms