Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SELENBP1Q13228 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENBP1Q13228 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms