Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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