Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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