Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms