Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FOXD4Q12950 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FOXD4Q12950 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FOXD4Q12950 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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