Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP160Q12769 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP160Q12769 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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