Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms