Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LOXL1Q08397 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LOXL1Q08397 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms