Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNG1Q06432 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms