Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TMEM92-AS1-201ENST00000508851 750 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms