Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XPCQ01831 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XPCQ01831 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms