Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD1P98174 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD1P98174 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms