Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELF3P78545 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELF3P78545 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ELF3P78545 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ELF3P78545 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ELF3P78545 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ELF3P78545 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms