Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP1P63208 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKP1P63208 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP1P63208 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP1P63208 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP1P63208 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP1P63208 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP1P63208 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP1P63208 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms