Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTBP2P56545 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTBP2P56545 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms