Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TPD52P55327 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms