Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLTPP55058 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLTPP55058 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLTPP55058 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLTPP55058 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms