Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MVDP53602 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MVDP53602 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MVDP53602 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MVDP53602 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MVDP53602 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MVDP53602 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MVDP53602 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
MVDP53602 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVDP53602 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms