Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLK1P49759 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms