Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP4P49662 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP4P49662 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP4P49662 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASP4P49662 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASP4P49662 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP4P49662 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP4P49662 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP4P49662 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms