Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms