Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms