Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ARL3P36405 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL3P36405 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL3P36405 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL3P36405 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL3P36405 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ARL3P36405 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ARL3P36405 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ARL3P36405 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms