Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms