Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFC1P35251 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFC1P35251 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFC1P35251 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFC1P35251 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFC1P35251 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFC1P35251 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFC1P35251 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFC1P35251 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms