Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms