Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCKBRP32239 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCKBRP32239 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms